Çene cerrahisi, ortognatik cerrahi olarak da bilinir, üst ve alt çenelerdeki asimetrik farklılıkları düzelten bir tedavidir. Çene cerrahisi; yanlış hizalanmış çeneleri veya yanlış kapanışı düzeltmek için yapılır. Günümüzde, bunu yapmanın bir diğer nedeni de çene estetiği sağlamaktır. Ortodontik tedavi çarpık dişler gibi sorunları düzeltebilse de, alt ve üst çene hizalaması gibi büyük sorunlar için düzeltici ortognatik cerrahi gerekir.
Ortodontik tedavi sırasında dişlerdeki şekil bozukluğu giderildikten sonra telleri çıkarmadan ameliyat yapılır. Alt çenenin normalden küçük veya geride olması durumunda çene kemiği kesilerek öne alınır ve oluşan boşluğa kemik dokusu transfer edilir. Titanyum plak ve vidalarla sabitlenir. Alt çenenin önde veya aşırı gelişmiş olması durumunda kemik dokusu kesilerek alt çene geri alınır. Kesilen vidalarla sabitlenir. Dişleri birbirine bağlamaya gerek yoktur. Beslenmede bir sorun yoktur. Oluşan şişlik bir hafta içinde geçecektir.
Alt çene ameliyatı hastanede genel anestezi altında yapılır. Bu ameliyatlar, bu tür ameliyatlarda oluşabilecek enfeksiyonlara karşı, steril ameliyathane koşullarında, tam teşekküllü bir hastanede yapılmalıdır. Bunlara dikkat edildiği sürece, enfeksiyon riski son derece düşüktür.